这种状况之下，为了维护京城内自家的安危，兴办一只强军可以说也是京城上下官吏的共识。只不过，大家争的是这只新军掌握在谁手中而已。
崇祯摒弃了由内监勋贵单独掌军的传统，设立军校和总参谋部，让孙承宗等文臣统领操练新军，消除了一部分文官们的戒心，算是赢得了最大的共识，新军也才能顺利编练出来。
但是随着皇帝亲征蓟州，初步炼成的新军击退了入侵关内的后金军队之后。朝中的文官们突然发觉，这只新军虽然名义上是孙承宗、袁崇焕等文官训练编制出来的，但是这只新军的内部封闭性更好，文官们根本影响不了新军内部的军官提升，从前的兵部现在倒是成了总参谋部的后勤部门了。
在这样的状况下，朝中差不多已经达成权力平衡的文官们，自然想着要腾出手来压制一波武臣势力上升的势头了。
奢安之乱的结束，对西南诸军的安置，也就成了文官们对于皇帝的初步试探。
朱燮元既然看明白了朝中局势，自然不愿意同执政的内阁阁臣们去唱反调。但是皇帝亲口点了自己的名字，他也不得不站出来发表看法了。
作为平息了奢安之乱的首功之臣，他对于西南局势的了解自然是超过了朝中的各位官员的。
要他闭上眼睛去附和内阁诸阁臣的意见，他是觉得不大妥当的。思前想后了许久，朱燮元终于对着皇帝行礼说道：“陛下，臣两度受命，在川、贵两地奔波对付叛逆，对于当地的风土人情倒也是略有所得…”
朱燮元没有直接表态支持那一方的意见，而是把自己在四川、贵州任职期间的经历，和对当地风土人情的了解讲述了一遍。
说完了这些之后，他才转回正题说道：“…以臣所见，自奢安之乱之后，贵州、四川的菁华之地大半被毁，我汉人百姓在这两地的人口也大量锐减，数十年教化之功也毁于一旦。
而在这场战乱之中，不仅我汉民损失惨重，当地土民的损失也同样不小。双方在战争中的互相仇杀之下，战乱之前当地各族百姓的睦邻友好关系，现在已经荡然无存。
当下在贵州，汉人村寨不许其他土民3人以上结队从村子边上经过，而苗、瑶等族百姓则同样拒绝汉人进入自己的寨子休息，各族百姓之间的关系可谓是剑拔弩张。
如果朝廷以为奢、安两家土司服软，西南地方就能回到战争之前的社会，无疑是想的太过于简单了。”
郭允厚忍不住向他发问道：“那么按照朱大人的意思，朝廷还需要向西南拨款多少年，才能让西南恢复到战乱之前呢？”
朱燮元沉吟了一下，终于委婉的说道：“需要多久才能让西南地区恢复到战乱之前，臣实在是不知。
但是臣以为，想要消除西南地区继续发生叛乱的隐患。一是向西南持续迁移汉民，在这次战乱之中，只有汉民才是真正愿意支持朝廷官军的。
其他各族虽然没有参与叛乱，但也只是闭门自守，很少愿意协助朝廷官军平叛。只要汉民在当地的数量占据了一半以上，西南的局势才会有真正的缓和可能。
二是将有功将士分别安置在各要道冲口，把从叛逆中缴获的土地分给这些有功将士，则将士们自然会感念朝廷的恩德，替朝廷镇守地方，隔绝地方上各族百姓的冲突。而且也能减少朝廷对于西南地区的军费拨款…”
原本还对朱燮元的说法有所不满的内阁阁臣们，听了他最后的建议之后，终于脸色缓和了下来。把这些有功将士分拆安置，显然也是符合他们心意的。
不过在朱燮元之后发言的秦良玉，却皱着眉头说道：“总督大人前面说的臣都赞成，唯独这把有功将士分镇各地，臣以为不可…”
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