因为对异常没有实质了解或缺乏技术来妥善收容或抵抗，基金会往往无法顺利地收容这些SCP。
一个Keter级SCP不代表SCP很危险，只是纯粹地非常难以收容或是收容代价极高。
例如一只会在全世界随机传送的猫咪可能会被分级为Keter。
Thaumiel：Thaumiel级SCP为基金会用于收容或抵制其他SCP或异常现象的异常。
仅存的一些Thaumiel级项目都是基金会的最高机密，而它们的位置，功能，及现况只为O5议会以外的少数基金会人员所知。
无效化(Neutralized)：已无效化的SCP是已被有意无意地破坏或失效而不再异常的异常。
非标准项目等级
以下的项目等级为就项目的主要（或以前的）分类作出补充的子分级。
已解明(Explained)：已解明SCP通常为关于已经完全充分被理解并能以主流科学所解释，或是被揭穿被错误地认知为异常的现象。
机密叙述式等级(EsotericNarrativeClasses)机密项目等级（偶尔也称作叙述式等级）是未分到上述任一部分的项目等级。
它们通常只在特定SCP被使用一次，并被用来推动叙述。
强烈建议SCP使用这里的标准项目等级之一。
虽然一些作者选择引入这些规则的例外，但只有少数能做到并需要去证明它们的存在跟定位是正当的。
许多网站成员会对没有价值的使用非标准项目等级差评。
一个被较多使用的特殊分级的例子是Apollyon，它被用于一些具有灭世能力且难以被阻止的SCP。
此外，一些待分级的项目和某些具有meta效应的项目也会被加上这个分级。
被处决(Decommissioned)：被处决的SCP是过去由高级工作人员使用的项目等级，不只删除掉有缺陷的文档，还把它们置于“耻辱墙”来作为别这样做之例子。
此项目等级已不再使用。不再做废除文档部分是因为SCP职员不再被允许此类大手笔的修改，另一部分因为废除条目最终造成了反效果。
参阅宇宙史中心以取得关于以往被处决的SCP和对它们的处理之历史信息。
异常项目(Anomalous)：异常项目指具有异常性质但没有达到被划分为SCP的标准，不值得后续关注的项目。
严格来说，异常项目并非SCP项目等级，但有些项目经历了先被划分为异常项目，再被划分为SCP的经历，因此这个等级会体现在项目等级的历史上。
已废弃未使用的项目分级
已废弃
多重分级：某些老祖宗级别SCP会使用多重分级，如Clef博士的提案、SCP-296。
这种分级方法不再被容许，并正逐步取缔中。
被处决(Decommissioned)：见上方。
未使用
希腊字母式威胁等级：SCP基金会曾提出用AlphaBetaGamma的方式标注项目的危险程度，但没有实施。
项目收容系统
以下子类分级为项目等级以及被指定为收容等级的传统分级，目前被收录于“机密分级完整列表”中。此分类系统仅用于完善目前基于项目等级建立的分类系统，并不替代项目等级。
（举例：项目等级：Artifact；收容等级：Safe）
它们表示被收容的项目的特征并可相互结合使用。
（举例：ArtifactAudiovisual）
Artifact：人造物品
Audiovisual：音像
Avian：鸟类
Canine：犬类
Crustacean：甲壳类动物
Divine：神圣的
Ectoentropic：反熵
Edificial：建筑
Event：事件
Extraterrestrial：地外
Geographical：地理位置
Humanoid：人形
Insectoid：昆虫
Instrument：器具
Mechanical：机械
Online：联网的
Memetic：模因
Parauniversal：项目异常地影响宇宙或与宇宙相互作用。
Pathogen：病菌
Plant：植物
RealityAlteration：改变现实的
Telepathic：心灵感应
Textual：文本
异常分类系统（ACS）
一套新的、更完善的异常分类系统（AnomalyClassificationSystem，简称ACS）被应用及推广，以对现有的项目等级进行细化及补充。
ACS并未取代传统的项目等级制度，也并不是被含有“指导”标签的官方设定。
不同于项目等级是标准文档格式的一部分，是否使用ACS由作者自行决定。
目前ACS已在部分项目(主要在主站的系列IV、系列V、系列VI及CN分部的系列II中)中使用，一些老项目也更新添加了ACS分类框。
ACS系统中包含了多个层面的分类，包括：
许可等级
作为原安保许可等级的扩展，该等级代表设定中这个文档能被什么级别的人查看。
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