总督漕运兼提督军务巡抚凤阳等处兼管河道，这一长串头衔的背后隐含着巨大权利，虽然比起原先的正一品的五省总督来讲，现在的品级仅为正二品，但陈奇瑜已经非常知足了。
提督五省军务听上去很威风，但那可是个累死人的差事。
每日都要接到雪片般的各地匪情塘报，然后还要从这些情报中分析出何处的流贼为祸最深，其下一步的流窜方向是哪里，应该在哪里调兵堵截，调多少兵力才能打赢，何地能筹措到粮饷等等等等诸多问题。
五省总督没有固定办公场所，哪里大兵聚集，总督就要赶往该地亲自指挥，其实主要是督阵，防止某些总兵大将出工不出力。更要防止杀良冒功，坐视友军被困不去援助，私纵贼寇等黑暗事情的发生。
当然了，就算总督亲临，很多事还是会照样发生，但某些大将不敢明目张胆去做。
五省总督最大的风险还在于剿贼不利，陈奇瑜恰恰是犯了这条大忌才身陷囹圄。
说起来真是冤枉他，老陈剿贼那真是有两把刷子。在任上总共不到一年，把高迎祥、张献忠、李自成等一众匪首撵的到处乱窜，要是车厢峡之事自己上点心就好了。
陈奇瑜暗自叹了口气，自己当时太膨胀了。以为已经毕其功于一役，剩下的就是回到京师后，在朝廷重臣们羡慕嫉妒恨的目光中接受皇帝的封赏了，按照如此大功，至少是个兵部尚书，要是皇帝一高兴，入阁也不是不可能，位极人臣可是一辈子的荣耀。
世上没有后悔药，在诏狱中待了数月，陈奇瑜对现在的一切感到分外的珍惜。
他有时觉得挺佩服自己的。
虽然蒙皇帝特简出狱成为凤阳巡抚，可要不是自己敏锐的察觉到寿州之战的重要性，要不是自己未雨绸缪，将徐州兵事先揽到麾下，要不是自己当机立断，亲率大兵赴援寿州，与卢建斗合力取下这场大胜，那自己无论在凤阳如何折腾，都不会引起皇上的注意，只要被皇上遗忘，那再想升迁就几乎不可能了。
现在终于如愿以偿了，皇上真是慧眼识人啊，哈哈！只要自己在这个重要位置上干出一番业绩来，那重返京师位列殿堂之上也是顺理成章的事了。
淮安是大运河的中段，是黄淮交汇的地方，也是整个漕运的关键，宣德二年朝廷遂在淮安府开府建牙设立了督管运河的总兵府。
后因漕运事务逐渐繁忙，而漕运又广泛牵涉到各省行政、军务，需要做大量的协调工作，不是一个武臣所能办得了的，所以朝廷经常临时派遣侍郎、都御史、少卿等文职官员参与督运。至景泰二年(1451)，朝廷认为文官的参与必须常态化，所以奏请皇帝设立了漕运总督，并将原先的漕运总兵府改为总督府。
漕运总督长长的头衔中，提督军务这一条可是相当厉害。这就是说可以和其他各省的总督一样，拥有一定的兵权，并且漕运总督麾下兵马真是不少，名义上总督麾下足有两万余战兵，还有人数多达十二万的运军，就是跑船的这帮漕军。
漕运总督统领颍州兵备道、徐州兵备道、淮扬海防道，中都留守司之凤阳等7个卫，洪塘守御所，南直隶之庐州卫、扬州卫、高邮卫、仪真卫、滁州卫、徐州卫、淮安卫、大河卫、邳州卫、沂州卫、泗州卫、寿州卫、宿州卫，海州中守御所。所以漕运总督人称为帅、大帅、漕帅，他设有军门，有中军，左营、右营、城守营。他所在的淮安城的守卫，不须地方政府如山阳县、淮安府的来管，而是由漕运总督署城守营负责，地方官府只是协助而已。有战事还可调动所辖范围内的军队，如扬州营、徐州营等。
总督的权限包括督理钱粮、操练兵马、修理城池、抚安军民、禁革奸弊等事项。如有战事发生，可以选将调兵，组织备战。对于才能不济或是不听命令的官员，文职五品以下，武职四品以下，都可以参究、拿问乃至以军法从事。至于上书弹劾，致某一下级官员被贬被杀，更是小菜一碟了。
到任总督已经月余，跟随自己参加寿州大战的凤阳卫都已回归原位，郭太的徐州兵在把俘虏押送到淮安后，也回了徐州驻地。郭太此次叙功被朝廷擢升为徐州副总兵，因而对陈奇瑜更是俯首帖耳，两次跟随陈大人都能升官，这样的好事上哪找去。
卢象升带着天雄军和辽东骑兵以及黄得功部向湖广一带挺进，继续追缴张献忠等巨寇。
寿州之战俘获的五万余人已经在总督衙门兵丁的监护下，由工部都水司的郎中划分区域，开始对堵塞严重的运河中段进行清淤工作。
五万余人被分为二十队，每队不到三千人，由一百兵丁看守，在工部吏目的指挥下展开作业。
陈奇瑜自知不懂此间事物，所以将此事全权交于了工部郎中董藩。在吩咐下陈奇之督办清淤所需粮食之后，他便带人开始四处巡查走访，力求短时间内对漕运一事有所了解，到时好给皇帝上本，陈说其中利弊，以便使自己在皇帝眼中的良好形象再加几分。
这些俘虏绝大部分是农户出身，都是因田亩绝收才加入流贼队伍，所求无非是能吃顿饱饭，甚至吃不饱也行，总比等在家中饿死要强。但其中也有不少本性凶残之辈，奸淫掳掠的恶事没少干。
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