1905年12月1日，美国国务院将起义需要的文件等物品交给了瓦里亚，包括军事计划、密电码、独立宣言文稿、巴拿马宪法、国旗等等，瓦里亚自己预支了50万法郎给阿马多，作为起义经费。12月20日，阿马多返回科隆，他虽对此行的成果感到欣慰，但又觉得光凭一个法国人的承诺，就拿自己的命运、事业甚至生命去冒险有些不妥，关键时刻，阿马多的妻子多尼亚?玛丽亚给了他巨大的精神支持。这时，经过革命者的游说再加上5万美元的赠款，哥伦比亚驻军司令埃斯特万?乌埃尔塔斯决定加入“爱国者小组”，这对起义来说无疑是雪中送炭。
很快，阿马多又用3.5万美元收买了一位哥伦比亚炮艇艇长，事情发展到这一步，哥伦比亚政府终于察觉了巴拿马政局的异常动向，立即派2名将军率领40名士兵乘一艘炮艇前往科隆，以防非常事变，但此时美国巡洋舰“纳什维尔”号突然开进科隆港，公开阻止哥伦比亚军队进入巴拿马城。
1906年1月3日，两位将军刚到巴拿马城就被已经叛变的乌埃尔塔斯逮捕了。阿马多通知美国领事馆，巴拿马已经与哥伦比亚正式脱离关系，阿兰戈父子在巴拿马城的大教堂广场，当众宣布成立巴拿马临时执政委员会，委员会的成员包括巴拿马精英分子和美国铁路公司的高级职员。
当晚，巴拿马市议会举行特别会议，承认了这个新政权。而哥伦比亚政府面对美国的巨大军事压力，也不敢吭声，默认巴拿马独立。
1月4日，巴拿马举行群众，宣布独立，推选阿马多为共和国首任总统，阿马多在会上致辞时高呼：“巴拿马共和国万岁！罗斯福万岁！美国万岁！”的口号，成为世界外交史上的一个趣闻。
对于巴拿马的独立，一位美国参议员写道：巴拿马人民是站起来了，像11个人一样！因为巴拿马独立起义是在美国支持下，由7个巴拿马人和4个美国人策划的。古斯塔夫?阿道夫?梅利安德写道，“巴拿马是为了便宜而嫁给美国”，是一个“损害主权的杂种国家”。埃里克?莱昂则认为，巴拿马是一个“得了萎缩症的国家”。
巴拿马独立后，美国立即催促新政府废除修建巴拿马运河一事，全部赔偿金由美国支付。瓦里亚也被巴拿马政府任命为驻美国公使，授予他跟美国签订运河条约的全权。
此时，中华帝国正处于对英国作战的关键时期，不想把美国扯进去。因为王辰浩很清楚，当年如果不是美国不断的向英国输出战略物资，英国在德国的潜艇战打击下，根本坚持不到一年就得投降。因此，中华帝国在这个时候不得不对美国退让。
然而，中华帝国即便暂时退让也是有目的的，跟巴拿马政府谈判不断的拖延时间。巴拿马要收回运河，于是中华帝国就开出20亿美元的天价，以为可以吓唬住巴拿马政府。岂料美国人为了夺取这条运河权利，竟然支持巴拿马政府同意。
面对这种情况，中华帝国政府已经知道美国对巴拿马运河势在必得了。在王辰浩看来，巴拿马政府20亿美元收购这条运河，肯定是美国人掏钱，之后美国人将获得运河运营权，但至少需要12年才能收回成本。
此时，中华帝国已经对英国形成了一定的优势，而且中华帝国正在暗中组成八国集团，一旦完成八国联军对英战争的态势，则王辰浩就可以高枕无忧了，因为英国肯定打不过八国联军，战败是必然的。
王辰浩心中有数了，但美国人在巴拿马问题上始终跟中华帝国作对，必须要狠狠的教训美国人一顿才行，让美国人吃个大亏才能解王辰浩的心头愤怒。
公元1906年4月，中华帝国同意了巴拿马政府的要求，愿意将巴拿马运河以20亿美元的价格还给巴拿马政府。
中华帝国代表特意强调是还给巴拿马政府，而不是转让给美国，这个字眼并没有被巴拿马政府和美国政府所重视。双方于是很快签署了合同，但中华帝国要求必须把钱款付清之后，才可以将运河转给巴拿马政府。
对此，巴拿马政府和美国政府协商后，立即同意了。
1906年9月，中华帝国已经取得了对英作战的辉煌胜利，和英国签署了停战合约，这让美国感到了来自中华帝国的巨大军事威胁，但是此时美国政府认为中华帝国已经签署了合同，自然不可以反悔，因此美国政府紧急筹集了20亿美元的资金，要求巴拿马政府立即跟中华帝国换约。但是20亿美元的资金不是那么容易筹集的，美国政府跟美国民间大商人们借钱，直到第二年夏天才筹集到这笔巨款。
1907年7月13日，中华帝国同巴拿马政府签署了运河权归还给巴拿马政府的合同，巴拿马政府将从美国获得的20亿美元转交给中华帝国政府。
按照合同规定，中华帝国在得到20亿美元的赎买费后，将运河交给巴拿马政府。随后，巴拿马政府立即跟美国谈判，准备将运河卖给美国。此前，美国已经花了20亿美元了，根本不想再掏钱了，但是巴拿马政府刚刚成立，急需要资金，必须跟美国要钱。于是，双方展开了 口水战，僵持了下来。
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