四川、云南、甘肃、奉天、吉林、黑龙江等地也部署两镇兵力，这是出于地域和国防安全考虑。云南、四川、甘肃等地区路途遥远，但战略性极为重要。例如英国不断蚕食云南地区的中国领土，一旦发生突发事件，临近地区的军队无法及时增援，因此需要增加兵力。
西藏地区也部署了一镇兵力，这主要是王辰浩的个人主张，国防部和总参谋部一开始并没有安排兵力驻藏，在王辰浩的特别指示下，总参谋部才派一镇兵力入藏。本来王辰浩的计划是派两镇兵力入藏，因为英国人一直对西藏虎视眈眈，不断的侵吞蚕食西藏的中国领土。道光末年被英国侵占的西藏拉达克地区，9.2万平方公里的土地被英国人占了去。用不了多久英国人还会炮制非法的麦克马洪线，王辰浩先知先觉，因此对西藏重点防护。
但是，在总参谋部官员们看来，王辰浩属于站着说话不腰疼那伙的。西藏地处高海拔地区，军队驻扎在西藏将面临高原病、补给困难、生活困难的威胁，两镇兵力驻扎在西藏，其军费开支相当于京畿地区的六镇军队，而且很多事情不是增加军费就可以解决的。
最终，总参谋部说服了王辰浩，只向西藏派驻了一镇兵力。
对于蒙古地区，王辰浩的各项改革都没有提及蒙古，因为蒙古地区自清帝国建立那天开始，就一直处于高度自治状态。蒙古大部分地区还处于游牧时代，其他地区是封建奴隶制并存，蒙古的封建王公大臣们享受着****的待遇。
蒙古地区是否改革对王辰浩推行的帝国新政影响不大，甚至可以忽略不计。正是因为这个原因，王辰浩并没有对蒙古下达强制性改革命令。
但出于战略考虑，蒙古200多万平方公里的巨大战略纵深是王辰浩所看重的，有蒙古大漠护住中原地区，王辰浩可以游刃有余的准备对俄战争。
另外，王辰浩的军队当中急需要征召大量的骑兵部队，蒙古战马、蒙古部族骑兵是最佳选择，王辰浩出于各种利益考量，继续维持蒙古地区的封建体制，维护蒙古王公贵族们的利益，以此来获得蒙古七十二部的大力支持。
派驻蒙古的两镇军队除了巩固帝国对蒙古地区的统治之外，更重要的是蒙古拥有规模庞大的工业矿藏。例如蒙古拥有一万亿吨储量的易开采露天煤矿，拥有世界级规模的铁矿、铜矿、铬矿，以及储量世界第一的稀土矿，而后者是王辰浩最看重的军事工业所需原材料。
王辰浩计划在蒙古地区打造第二处工业基地，该基地以原材料的采集为主。目的是将优质煤炭，各种矿石，各种稀土原料源源不断的向京津唐工业基地输送，加速中国的工业发展和工业化进程。
对于中国的殖民地关岛和波多黎各，二地共用一镇兵力，每地派驻一个协。关岛人烟稀少，一个协兵力足够了。波多黎各人口稠密，比较富裕，但是距离本土太远，王辰浩只把波多黎各当做一个战略支点，当做是参与美洲事务的踏脚石，因此在波多黎各也只驻扎一个协的兵力。驻地在波多黎各的布坎南堡，陆军部在那里设立的陆军基地，资金以波多黎各赋税支付。
常备陆军的规模和编制完成改革后，国防部和总参谋部就驻扎在各省的中国陆军划分了相应的军事基地、军事警戒区和兵源补充区。例如京畿直隶省的军事驻防区为北苑、南苑、军马场、保定、秦皇岛等地区，兵源采取就地补充原则，每镇陆军都有自己固定的兵源补充区，不得跨省补充兵源。
常备陆军实行义务兵役制，每年固定退役一半士兵，补充一半新兵。普通士兵标准服役两年，两年后表现优异可留作士官，士官作为中国陆军基层指挥力量，其作用巨大，因此士官前五级可服役十年，六级士官长可服役至五十岁退休。军官则有严格年龄限制，尉官军官可服役至四十岁必须退役，校官服役至五十岁必须退役，将官服役至六十岁后视具体情况选择退役。
国防部和总参谋部对全国陆军的改革之后，帝国常备陆军对外宣称数字为五十四万人。但实际上，这只是国防部的隐藏真正实力的一个计策而已，这个数字只是三十六镇常备陆军的数量。禁卫军和御林军还有六万人，驻琉球王国独立师两万人，各省国民警卫队、警备区戍守部队共计三十万人，还有蒙古各旗的骑兵部队并不计入常备陆军序列当中，蒙古七十二部共计拥有蒙古骑兵十五万人，这些蒙古骑兵也按时接受训练，骑兵装备也由总装备部发放，军饷也由帝国财政部支出，他们实际上也在帝国常备陆军的战斗序列之内，但这些都没有计算进去。
常备陆军的编制和驻防确定后，总装备部和总后勤部紧随改革步伐。总装备部将帝国陆军现有装备全面升级换代，装备适合东方人使用的武器装备，主要换装了轻便、灵活、稳定的勃朗宁系列步枪、手枪和重机枪。
近百万陆军更换装备不是一时三刻就能完成的，换装从王辰浩的二十镇嫡系北洋陆军开始，北洋陆军淘汰下来的德国系列枪械交给其他各省组建的帝国陆军使用，国民警卫队和警察部队依然使用他们原先的武器装备。等到各省的帝国陆军完成武器换装之后，再将淘汰下来的德国系武器给国民警卫队和警察使用。这样一批批，按照重要性依次进行替换，最终完成全面换装。
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